首先，本文針對的熟料栽培，包括袋栽，也包括瓶栽，以及原種和栽培種。
一、細菌污染的表現(xiàn)
1、無表現(xiàn)：菌絲正常生長，外觀顏色，濃密度等均正常，而實際菌絲中混雜著細菌。
2、輕微表現(xiàn)：菌絲看起來局部或者整體顏色灰暗，或者局部生長受阻。
3、嚴重表現(xiàn)：菌種接種不能正常萌發(fā)，不能正常吃料，甚至整個菌包變軟，沒有菌絲。
二、細菌污染帶來的影響
1、污染率升高，成品菌包減少，生產(chǎn)成本增加。
2、產(chǎn)量下降，細菌消耗營養(yǎng)，菌絲活力受到影響，單產(chǎn)下降。
3、引起出菇病害，常見的就是各種的爛菇，以及其他一些細菌性的子實體病害。
三、導致細菌污染的原因
1、菌種：
液體菌種感染細菌，沒有檢測到。
這種的表現(xiàn)：輕微時外觀無表現(xiàn)，嚴重時液體菌種接種后不能萌發(fā)，或者菌絲灰暗，稀疏，不潔白。
液體菌種引起的細菌性污染，大多數(shù)情況是以一個發(fā)酵罐接種的數(shù)量為單位出現(xiàn)，規(guī)律性比較明顯。
固體菌種攜帶細菌，通常是菌種本身污染，或者受過高溫，或者高溫運輸，或者長期存放的菌種。
這種的表現(xiàn)：染菌的部位是在料面接種塊開始，在菌種萌發(fā)就開始表現(xiàn)萌發(fā)不正常，萌發(fā)較慢，不吃料。
2、滅菌
因為滅菌不徹底，溫度不夠，時間不夠等導致。
滅菌不徹底引起的細菌污染，打開袋子有明顯的酸臭味道，一般在接種后的5-7天開始表現(xiàn)出來。
一般除了細菌，同時會伴隨酵母菌，以及其他的霉菌同時污染。
3、培養(yǎng)基含水量過大
培養(yǎng)基含水量過大，菌袋在（瓶）的底部有大量的積水，菌絲不能正常的生長，逐漸滋生細菌。
4、培養(yǎng)過程高溫
因培養(yǎng)室溫度過高，或者擺放的密度過大，導致菌絲在很高的溫度生長，這個過程一定不是無菌環(huán)境，細菌在高溫環(huán)境中開始快速繁殖，表現(xiàn)為細菌污染，這種情況容易出現(xiàn)黃水或者紅水。
注意：接種、微孔、培養(yǎng)等環(huán)節(jié)，一般不會導致細菌感染，因為細菌的通過空氣可以侵染，但是這種外來的細菌侵染后生長很慢，一把不會有影響。
所以通過上面的分析，細菌污染一般是來自內(nèi)部的，就好比蘋果放在那，自己就會爛掉，而且是從內(nèi)部爛掉的。
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